Secvențierea ARN single-cell (II). Aspecte practice

* În prezent există numeroase metode experimentale și de calcul pentru Secvențierea ARN single-cell * Cea mai mare provocare experimentală o reprezintă izolarea celulelor reprezentative dintr-un organ sau țesut, fără a afecta expresia genică. * Cea mai mare provocare în partea de calcul o reprezintă normalizarea datelor. Un aspect important al izolării ARN-ului din celule […]

Secvențierea ARN single-cell

Transcriptomul este suma tututor secvențelor de ARN mesager exprimate într-un organism. La un moment dat, celulele dintr-un țesut exprimă gene diferite, sau, dacă exprimă aceleași gene, acestea sunt exprimate în cantități diferite. Transcriptomica în masă (in bulk) presupune măsurarea cantității de ARN mesager dintr-un țesut întreg, compus din mii de celule, și raportarea mediei exprimării […]