Publicarea genomului personal, de la testarea genetica, la genealogie

Nu de multe ori am avut ocazia de a participa la o discuție de grup, care să nu aibă de a face cu domeniul politic, în care părerile invitațiilor au fost atât de omogene. Joi 11 aprilie a avut loc in Genome Campus o discutie despre utilitatea publicarii și împărtășirii, în zona publică, a ADNului […]

Bebelașii CRISPR – o problemă de știință și etică

Acest text este o traducere a blogului CRISPR babies – a consideration of the science and ethics, publicat de Ewan Birney, Director al Institutului European de Bioinformatica (EMBL-EBI) pe data de 26 Noiembrie, 2018. Luni, 26 noiembrie 2018, a apărut în presa de specialitate, și nu numai, povestea oamenilor de știință chinezi din Shenzhen, care […]

33 de bebeluși sub 1 an au murit anul acesta în România datorită rujelolei

Copiii sub 1 an nu sunt vaccinați împotriva rujeolei, deoarece vaccinul ROR se poate administra numai după vârsta de 1 an și, totodată, ei sunt cei mai vulnerabili la această boală. Practic, copiii sub un an, trebuie să se bazeze pe faptul că ceilalți oameni, mai mari sunt vaccinați, pentru a nu le transmite boala. […]

De la secvențierea Sanger, la secvențierea de generația a treia (PacBio și Nanopore)

De ziua lui Frederick Sanger, să recapitulăm câteva lucruri despre evoluția metodelor de secvențiere. Secvențierea ADN a devenit o tehnică de biologie moleculară aplicată la scară largă încă din anii ’80, odată cu invenția secvențierii Sanger în 1977, invenție care i-a adus lui Frederik Sanger premiul Nobel în anul 1980. Secvențierea Sanger se mai folosește […]

Secvențierea ARN single-cell (II). Aspecte practice

* În prezent există numeroase metode experimentale și de calcul pentru Secvențierea ARN single-cell * Cea mai mare provocare experimentală o reprezintă izolarea celulelor reprezentative dintr-un organ sau țesut, fără a afecta expresia genică. * Cea mai mare provocare în partea de calcul o reprezintă normalizarea datelor. Un aspect important al izolării ARN-ului din celule […]

Secvențierea ARN single-cell

Transcriptomul este suma tututor secvențelor de ARN mesager exprimate într-un organism. La un moment dat, celulele dintr-un țesut exprimă gene diferite, sau, dacă exprimă aceleași gene, acestea sunt exprimate în cantități diferite. Transcriptomica în masă (in bulk) presupune măsurarea cantității de ARN mesager dintr-un țesut întreg, compus din mii de celule, și raportarea mediei exprimării […]

Afaceri profitabile bazate pe date bioinformatice gratuite, din domeniul public

Multe dintre datele generate de industria de biotehnologie sunt stocate în baze de date publice și de multe ori acestea pot fi folosite în regim freeware și open source. Încă în faza incipientă, câteva companii au început deja să exploateze aceste date și să genereze profit. Companiile care exploatează aceste date se împart, în mare, […]

RSBI – Comunitatea Română de Bioinformatică

Vara trecută, Monica, Bogdan și Mihai din Cambridge s-au hotărât să întemeieze o comunitate de bioinformatică în România (RSBI), cu scopul dezvoltării cunoștiințelor de bioinformatică în România, pentru a susține dezvoltarea cercetării în biotehnologie și pentru a susține medicina personalizată. În acest sens, am contactat pe d-nul Prof. Horia Banciu de la Universitatea Babeș-Bolyai din […]

Experimentul Lenski a împlinit 30 de ani

Experimentul Lenski, descris mai pe larg într-un post precedent, a împlinit 30 de ani. Timp de 30 de ani, 64 de persoane au contribuit la transferul zilnic al bacteriilor E. coli, dintr-un tub într-altul, pentru a observa “evolutia bacteriilor în acțiune”. În acest timp, doar una dintre cele 12 populații inițiale a evoluat să folosească […]

Editarea genelor in embrioni umani, legala in Marea Britanie

Marea Britanie a permis ieri editarea genetică în embrioni umani, iar dreptul de a face experimentele i-a revenit lui Kathy Niakan de la Institutul Crick din Londra. Despre editarea genetică am mai scris aici, încercând să descriu mecanismul biologic și pe oamenii de știință care au adus contribuții majore la biotehnologia CRISPR. Știrea care a […]