13 țări europene au semnat “o alianță a datelor genomice”

13 state europene au semnat o declarație prin care se angajează să ofere acces la date lor genomice și celorlalte state.Acesta este un pas imens în față pentru cercetarea medicală și felul în care se face medicină în Europa.Punerea la comun a datelor genomice va îmbunătăți înțelegerea modului în care se declanșează anumite boli și […]

Publicarea genomului personal, de la testarea genetica, la genealogie

Nu de multe ori am avut ocazia de a participa la o discuție de grup, care să nu aibă de a face cu domeniul politic, în care părerile invitațiilor au fost atât de omogene. Joi 11 aprilie a avut loc in Genome Campus o discutie despre utilitatea publicarii și împărtășirii, în zona publică, a ADNului […]

Către Cove și ProTV – invitați-i în emisiune pe parinții celor 62 de copii morți din cauza epidemiei de rujeolă, nu pe Olivia Steer

Către Cove și ProTV – invitați-i în emisiune pe parinții celor 62 de copii morți din cauza epidemiei de rujeolă, nu pe Olivia Steer Probabil ați urmărit de curând o emisiune la ProTV în care un doctor pediatru vorbește cu Ovilia Steer despre utilitatea vaccinării. Disputa celor doi creează impresia că cei doi sunt pe […]

Bebelașii CRISPR – o problemă de știință și etică

Acest text este o traducere a blogului CRISPR babies – a consideration of the science and ethics, publicat de Ewan Birney, Director al Institutului European de Bioinformatica (EMBL-EBI) pe data de 26 Noiembrie, 2018. Luni, 26 noiembrie 2018, a apărut în presa de specialitate, și nu numai, povestea oamenilor de știință chinezi din Shenzhen, care […]

33 de bebeluși sub 1 an au murit anul acesta în România datorită rujelolei

Copiii sub 1 an nu sunt vaccinați împotriva rujeolei, deoarece vaccinul ROR se poate administra numai după vârsta de 1 an și, totodată, ei sunt cei mai vulnerabili la această boală. Practic, copiii sub un an, trebuie să se bazeze pe faptul că ceilalți oameni, mai mari sunt vaccinați, pentru a nu le transmite boala. […]

De la secvențierea Sanger, la secvențierea de generația a treia (PacBio și Nanopore)

De ziua lui Frederick Sanger, să recapitulăm câteva lucruri despre evoluția metodelor de secvențiere. Secvențierea ADN a devenit o tehnică de biologie moleculară aplicată la scară largă încă din anii ’80, odată cu invenția secvențierii Sanger în 1977, invenție care i-a adus lui Frederik Sanger premiul Nobel în anul 1980. Secvențierea Sanger se mai folosește […]

Secvențierea ARN single-cell (II). Aspecte practice

* În prezent există numeroase metode experimentale și de calcul pentru Secvențierea ARN single-cell * Cea mai mare provocare experimentală o reprezintă izolarea celulelor reprezentative dintr-un organ sau țesut, fără a afecta expresia genică. * Cea mai mare provocare în partea de calcul o reprezintă normalizarea datelor. Un aspect important al izolării ARN-ului din celule […]

Secvențierea ARN single-cell

Transcriptomul este suma tututor secvențelor de ARN mesager exprimate într-un organism. La un moment dat, celulele dintr-un țesut exprimă gene diferite, sau, dacă exprimă aceleași gene, acestea sunt exprimate în cantități diferite. Transcriptomica în masă (in bulk) presupune măsurarea cantității de ARN mesager dintr-un țesut întreg, compus din mii de celule, și raportarea mediei exprimării […]

Afaceri profitabile bazate pe date bioinformatice gratuite, din domeniul public

Multe dintre datele generate de industria de biotehnologie sunt stocate în baze de date publice și de multe ori acestea pot fi folosite în regim freeware și open source. Încă în faza incipientă, câteva companii au început deja să exploateze aceste date și să genereze profit. Companiile care exploatează aceste date se împart, în mare, […]

RSBI – Comunitatea Română de Bioinformatică

Vara trecută, Monica, Bogdan și Mihai din Cambridge s-au hotărât să întemeieze o comunitate de bioinformatică în România (RSBI), cu scopul dezvoltării cunoștiințelor de bioinformatică în România, pentru a susține dezvoltarea cercetării în biotehnologie și pentru a susține medicina personalizată. În acest sens, am contactat pe d-nul Prof. Horia Banciu de la Universitatea Babeș-Bolyai din […]